藻类大量滋生繁殖，会带来一系列问题：

（1）产生大量微生物黏泥，使水质浊度升高，在换热设备低流速区如封头、列管、填料等处积聚黏泥，造成堵塞、淤积等现象，影响换热器的传热效率和冷却设备的冷却效率。

（2）菌藻微生物在自身新陈代谢过程中产生各种类型酸性物质，引起系统设备的酸性腐蚀。

（3）微生物在黏泥在金属设备表面不均匀沉积，会因氧浓差形成电池效应，引起垢下腐蚀。

（4）晾水塔壁及支柱及部分设备长满青苔，布满藻类黏泥，使循环水水质严重恶化。